Localisation : /ccc/store/cont007/fg0037/fg0037/rawdata/projet_BIL/

‘’’  ls /ccc/store/cont007/fg0037/fg0037/rawdata/projet_BIL/AAA/RunsSolexa/141127_SOUFRE_C4VJ6ACXX/  ’’’

 

Fichier fastq :

BIL_AAAOSW_1_1_C4VJ6ACXX.IND1_noribo_clean.fastq.gz 

BIL_AAAOSW_1_2_C4VJ6ACXX.IND1_noribo_clean.fastq.gz 

BIL_AAAOSW_1_C4VJ6ACXX.IND1_single_noribo_clean.fastq.gz  md5

BIL_AAAOSW_1_1_C4VJ6ACXX.IND1_ribo_clean.fastq.gz   

BIL_AAAOSW_1_2_C4VJ6ACXX.IND1_ribo_clean.fastq.gz   

BIL_AAAOSW_1_C4VJ6ACXX.IND1_single_ribo_clean.fastq.gz


Fastq dézipés et utilisés pour le mapping (à partir du dossier « Fastq originaux ») :

Localisation   :  /ccc/store/cont007/fg0037/gayelise/ressources/fastq/


Résultats du mapping (dossier zipés) :

Localisation   : /ccc/store/cont007/fg0037/gayelise/ressources/fastq/mapping_on_published_version

1 dossier par échantillons  contenant les bam + des fichiers de résultats de comptage + log + script